1931 yılında Siirt’te doğdu. İlk ve orta öğrenimini Siirt’te, lise öğrenimini İstanbul Erkek Lisesi’nde tamamladı. 1960 yılında İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Tarih bölümünden mezun oldu. Lise ve üniversite yıllarında çeşitli siyasal ve sosyal etkinliklerde bulundu. 1962-1968 yılları arasında Başbakanlık Arşiv Genel Müdürlüğü’nde şef-uzman kadrosunda çalıştıktan sonra 1968 yılında Balıkesir Muharrem Hasbi Lisesi tarih öğretmenliğine atandı. Aynı zamanda Necatibey Eğitim Enstitüsü’nde ve Balıkesir Meslek Yüksek Okulu’nda Devrim Tarihi dersleri verdi. 1978 yılında Milliyet Gazetesinin düzenlediği “Elif Be’den Alfabeye Geçişin Türk Kültürüne Etkileri” konulu 19. Ali Naci Karacan yarışmasında birincilik ödülünü aldı. Kültür Bakanlığı Ulusal Kültür Dergisi’nde makaleler yazdı. Balıkesir İmam Hatip Lisesi Müdürlüğü görevinden sonra İstanbul Vefa Lisesi Tarih Öğretmenliğine atandı. 1986 yılında emekli oldu. “Başlangıçtan Günümüze Siirt Tarihi” adlı eseri, 2005 yılında yayımlandı. Eser, birçok tarihçiye ve araştırmacıya kaynaklık etti. TBMM kütüphanesinde yer almaya değer bulundu.
Fransızca ve Arapça bilen Bekir Sami Seçkin, evli ve üç çocukludur.